T-Zellrezeptor beta Umlagerungen bei Zöliakie
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Analyse von T-Zellrezeptor beta Umlagerungen bei der Zöliakie
Die Zöliakie (Sprue) ist eine häufige und oft schwer diagnostizierbare Erkrankung, welche i.d.R. durch eine Immunantwort gegen modifizierte Gluten Proteinfragmente ausgelöst wird. T-Zellen spielen bei dieser Erkrankung eine wichtige Rolle, doch ihre Bedeutung in verschiedenen Stadien der Erkrankung wird kontrovers diskutiert. Um die Rolle der T-Zellen mit dem Fokus auf die T-Zellrezeptor beta Umlagerung weiter aufzuklären, wurden in diesem Projekt von über 100 Zöliakie- und Kontroll-Proben T-Zellrezeptor beta Umlagerungen durch Amplifikation und Hochdurchsatz-Sequenzierungen generiert. Diese T-Zellrezeptor beta Sequenzen werden derzeit im Kontext von immunhistologischen und klinischen Daten analysiert, im Hinblick auf ihre pathologische und diagnostische Relevanz.
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Publikationen
Ritter J, Zimmermann K, Jöhrens K, Mende S, Seegebarth A, Siegmund B, Henning S, Todorova K, Rosenwald A, Daum S, Hummel M, Schumann M. T-cell Repertoire in refractory coeliac disease. Gut. 2017 Feb 10. doi: 10.1136/gutjnl-2016-311816. PubMed
Seitz V, Scharper S, Dröge A, Lenze D, Hummel M, Henning S. A new method to prevent carry-over contaminations in two-step PCR NGS library preparations. Nucleic Acids Res. 2015 Nov 16;43(20):e135. doi: 10.1093/nar/gkv694. PubMed